3 года. дисбактериоз.

Здравствуйте! Обращаюсь за советом!
дочке почти 3 года, она инвалид по неврологическому заболеванию (гидроцефалия и др. пороки мозга, шунтированная), почти все время лежит. С рождения была заколота антибиотиками, поэтому, естесственно, флора была убита напрочь. На сегодня имеем постоянные боли в животике, гипотрофию 3 степени (8 кг при росте 90 см), неустойчивый стул, сильные беспокойства по поводу дискомфорта в животе вплоть до невозможности спать. Из продуктов не едим кисломолочку, очень мало овощи и фрукты - все это способствует разжижению стула, отчего дочка очень беспокоится. Молоко время от времени добавляю в каши, но при обострении отменяю. Основная пища - каши, мясо, картофель, бананы, немного мучного - баранки, печенье.
Меня смущает вот что. Иногда девочка становится спокойней, и замечаю, что при этом она часто какает - небольшими порциями, после каждого приема пищи и иногда и чаще. Т.е. делаю вывод ,что ее беспокоит ,если стул задерживается в ней больше чем на один прием пищи.
О чем это может свидетельствовать? Ведь мало людей ,которые так часто какают. Это нормально или не очень? Гастроэнтерологи не находят у нас патологий, делали и УЗи неоднократно, и гастроскопию - незначительный гастродуоденит, сказали, что у всех присутствует такой.
При сдаче анализа на дисбак практически все время обнаруживается меньше нормы лактобактерии и присутствуют Эшерихии Коли 5х10 в 6 и клебсиелла пневмоника 5х10 в 4. Фаги пили все, какие есть. Бифидопрепараты - тоже.
Как избавиться от этих дряней?
Если б нам наладить кишечник и начать набирать вес, нам было бы значительно легче жить...