военкомат, общага, институт

А прописка тоже в Москве или где-то еще? Если где-то еще, то вы рискуете что начнут повестки приходить по месту постоянной регистрации и если по ней молодой человек не придет могут быть штрафы и другие ограничения.

Прописка в Москве там и живет. Общагу взял на всякий случай, там сделали временную регистрацию, но там не бывает практически. Только платит за нее. И далее мнения расходятся у всех. Никак не могу истину найти.

А зачем временную делали? Это вроде не нужно, если Москва/подмосква?

В общаге так сказали? Что вроде бы сами они там делают временную? Вообще какая-то каша, вот села разбираться.
Москва и Московская область ж один регион

Москвичам только один вуз дает общагу, там регистрация москвичам не нужна, подписывают договор, могут жить и в общаге, и дома, но прописка остается московская, домашняя.

Нет, Москва и МО - это разные регионы.

Нет, внутри своего региона на надо

События прям сейчас происходят. Сын в Москве на учет не встал. В институт уехал в другой регион, временно зарегистрирован и живет там в общаге. Встал вопрос о приписном и отсрочке.
Сначала его слалом в Москву, по месту постоянной регистрации, типа по временной военкомат его ставить на учёт не будет. Потом когда подтвердилось что он на учете не состоит, его сейчас будут ставит на учёт, и то после призыва. Там ничего электронного нет, поэтому выдали непонятную справку, что они ставят на учёт, что бы когда в Москве гостит, в метро не забрали.
Делаю вывод, что с временной регистрацией и отсрочкой связываться не хотят, шлют по месту постоянной.

Это военкомат ваш чудит. Мой сын спокойно встал на учет по временной регистрации при наличии в нескольких десятках км постоянной. И спокойно себе стоит и отсрочки ему оформляют быстро и без проблем. Да, постоянная регистрация тоже в Москве.

Конечно, не хотят. Так-то он закон нарушил.